El biodigestor es el lugar en donde se produce la fermentación anaeróbica (sin aire). Debe ser un lugar cerrado.
Hay varias maneras de construir el biodigestor y puedes usar un envase plástico o de vidrio. Lo principal es que una vez colocada la mezcla, solo se permita la salida del gas a través de una manguera o tubería, por lo que hay que sellar herméticamente todas las posibles fugas. Esto se puede lograr con silicona para colocar vidrios.
El diseño más simple de un biodigestor es usar una botella de plástico de dos litros. En la foto se ve un ejemplo de la parte superior del biodigestor:
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